Первый раздел Путеводителя составляют документы бывшего Общего архива Главного штаба в Петербурге и его Московского отделения (Лефортовского архива). Раздел включает характеристики фондов органов высшего и центрального военного управления.
Высшие органы были подчинены непосредственно носителю верховной власти и являлись, как правило, органами законодательства, верховного управления, надзора и суда.
Центральные органы управления (коллегия, министерство), исполняли законы, а также распоряжения носителей верховной власти и высших учреждений.
История становления системы военного управления России характеризуется противоречивостью законодательных актов, отступлением практики управления от принятых законов, отсутствием четкого разграничения функций учреждений. Структура органов военного управления подвергалась неоднократным изменениям. Построение раздела отражает этапы развития системы военных учреждений.
Раздел делится на четыре подраздела.
Первый – фонды высших органов государственной власти и канцелярий лиц императорской фамилии.
Второй – фонды Военной коллегии (XVIII в.).
Третий – фонды Главного штаба Е.И.В., бывшего непродолжительное время (1815–1832 гг.) центральным органом управления военного ведомства.
Четвертый – фонды Военного министерства (XIX – начало XX в.)