Приказом РВСР No.1 602 /291 от 19 августа 1920 г. формируемое Заволжским военным округом (на базе Управления ликвидированной 2 Революционной армии труда) армейское управление получило наименование Управления 6 армии. По постановлению РВСР No.5512/оп 1240/ш от 21 сентября 1920 г. армия включалась в состав вновь создаваемого Южного фронта (против Врангеля).
Приказом войскам Юго-Западного фронта No.907/сек 5243/оп от 7 сентября 1920 г. из 13 армии были переданы Правобережная и Херсонская группы войск, оборонявшие правый берег Днепра в районах Херсон, Каховка, Берислав, Чаплинка; 6 октября 1920 г. Херсонская группа переформирована в отдельную бригаду.
Для обороны каковского плацдарма приказом войскам армии No.13/оп от 25 сентября 1920 г. была образована Бериславская (Каховская) группа (51 и Латышская сд, позже 15 сд). Существовала до создания по приказу войскам армии No.3/К от 27 октября 1920 г. Ударной группы (51 сд, Огневая и Отдельная кавалерийская бригады, кавполки 15 и Латышской дивизий, автобронегруппа). После выполнения боевой задачи по овладению Турецким валом группа прекратила существование.
Приказом войскам фронта No.0011/пш от 5 ноября 1920 г. в оперативное подчинение армии передавались 2 Конная армия и Повстанческая армия Махно, а приказом No.0029/пш от 8 ноября 1920 г. 2 Конная вновь переходила в подчинение фронту. Ей в оперативном отношении была подчинена Повстанческая армия (директива No.0032/пш от 10 ноября 1920 г.).
С 9 декабря 1920 г. в подчинении армии состоял Черноморский укрепрайон.
С переформированием Управления Южного фронта в Управление командующего всеми вооруженными силами на Украине (приказ РВСР No.2660/532 от 3 декабря 1920 г.) армия перешла в подчинение последнего.
Приказом командующего войсками Украины No.620/236 от 13 мая 1921 г. армия расформировывалась, управление и войска передавались Харьковскому военному округу.
Дислокация штаба-гг. Кременчуг (сент.), Берислав (сент. -нояб.), Чаплинка (нояб.), Херсон (дек. 1920 -май 1921).
Войска армии вели оборонительные бои против войск Врангеля по удержанию каковского плацдарма (авг. -окт. 1920); во время контрнаступления Южного фронта в Северной Таврии (28 окт. -3 нояб. 1920) наносили главный удар с каковского плацдарма, освободили г. Перекоп; в Перекопско-Чонгарской операции (7-17 ноября 1920) по освобождению Крыма действовали на главном направлении, форсировали Сиваш, овладели Литовским полуостровом, укреплениями Турецкий вал и Юшуньские позиции, Перекопским перешейком; вели борьбу с отрядами Махно на территории Херсонской и Одесской губерний; несли охрану Черноморского побережья.