Военно-химическое управление было образовано приказом РВС СССР No.861 от 22 августа 1925 г. (на базе химического отдела Артиллерийского управления) при начальнике снабжений РККА и РККФ.
По объявленному этим же приказом положению на Управление возлагалось объединение научно-исследовательской работы в области военно-химической обороны, научный и технический контроль за производством предметов военно-химического снабжения, обеспечение войск всеми видами военно-химического довольствия.
Приказом РВС СССР No.390 от 22 июля 1926 г. Управление включалось в состав Управления снабжений РККА.
Приказом РВС СССР No.454/84 от 26 августа 1927 г. в состав Управления включалась инспекция химической подготовки ГУ РККА, на него возлагались функции военно-химической подготовки РККА.
По положению о центральном аппарате Наркомвоенмора, объявленному приказом РВС СССР No.200/40 от 21 октября 1929 г., Военно-химическое управление оставалось в составе Управления снабжений РККА.
В связи с учреждением приказом РВС СССР No.360/78 от 20 ноября 1929 г. должности начальника вооружений РККА в его подчинение передавалось Военно-химическое управление РККА.
С 1 мая 1932 г. (приказ РВС СССР No.074 от 4 июля 1932 г.) Управление становится центральным органом Наркомвоенмора СССР по руководству боевой и технической подготовкой химических войск и по военно-химической подготовке частей РККА.
По положению об НКО СССР от 22 ноября 1934 г. переименовано в Химическое управление РККА.
По приказу НКО No.055 от 9 апреля 1936 г. Управление подчинялось Главному управлению вооружения и технического снабжения РККА, а приказом НКО No.0156 от 11 октября 1939 г.-Главному управлению военно-технического снабжения Красной Армии.
Приказом НКО No.0037 от 26 июля 1940 г. Управление преобразовано в Управление военно-химической защиты Красной Армии.
Приказом НКО No.0066 от 13 августа 1941 г., ввиду усложнения задач химической защиты войск и увеличения объема работ, Управление реорганизовано в Главное военно-химическое управление Красной Армии.