Основана в 1753 г. на Гижигинской губе Охотского моря для обеспечения безопасности тракта, ведущего из Охотского порта на Чукотку и Камчатку, и сбора ясака. В 1783 г. Гижигинск получил статус уездного города. Крепость упразднена не ранее 1786 г. Административно-судебные функции переданы учреждениям военно-гражданской администрации.
В фонде отложились документы гижигинских городнического правления, нижней расправы, земского суда и штатной команды.