Образовано 14 июля 1867 г. из двух округов Сибирского казачьего войска. Состояло в ведении командующего войсками Туркестанского (1867-1882, 1899-1918) и Омского (1882-1899) военного округа. Войско осуществляло охрану восточных границ Туркестана и несло внутреннюю службу. Семиреченское казачье войско ликвидировано в 1920 г.