Образована постановлением Президиума ВЦИК от 22 сентября 1925 г. В состав Комиссии вошли члены Президиума ВЦИК М.И. Калинин, А.С. Енукидзе, П.И. Любимов, И.И. Кутузов, Р.П. Рейн и А.С. Киселев, кроме того, в состав Комиссии входил представитель Отдела Национальностей при Президиуме ВЦИК (впоследствии состав членов Комиссии менялся). В задачи Комиссии входили оказание помощи беспризорным детям, вовлечение их в трудовую жизнь и обучение ремеслам и общекультурным и политическим знаниям. Техническое обеспечение деятельности Комиссии осуществлял Секретариат. Местными органами Комиссии являлись комиссии по организации и распоряжению фондом имени В.И. Ленина при исполкомах областей, краев и республик РСФСР.
Постановлением Президиума Верховного Совета РСФСР от 3 декабря 1938 г. Комиссия была ликвидирована, а ее денежные средства переданы в фонд СНК РСФСР.