Армия образована на основании директивы командования Восточного фронта, отданной не позднее 21 июня 1918 г., из отрядов и частей, действовавших против чехословацкого корпуса и белогвардейцев в районе Уфа-Златоуст-Оренбург. Приказом войскам армии No.1 от 9 сентября 1918 г. объявлялось об образовании РВС армии.
До сентября 1918 г. в армии сохранялась отрядная система, отряды объединялись в несколько групп (направлений): Агрызская, Мензелинская (Гольянская), Группа ижевско-воткинского направления, Левая, Правая. Правая (Арская) группа в сентябре 1918 г. на время боев за Казань придавалась в оперативное подчинение 5 армии.
В связи с разделением (по решению совместного совещания РВСР и РВС Восточного фронта от 10 апреля 1919 г.) Восточного фронта на Южную и Северную группы армия вошла в состав последней, при этом 2 армии в оперативном отношении подчинялась 3 армия. Приказом командования фронта No.01318 от 17 апреля 1919 г. 3 армия подчинялась непосредственно фронту и Северная группа прекратила существование. В подчинении армии находился Сарапульский укрепрайон (июль-авг. 1919).
Директивой Главкома No.1116/ш от 23 июля 1919 г. армия расформировывалась, ее управление обращалось на формирование Управления Особой группы Южного фронта, войска передавались в состав Южного фронта, 3 и 5 армий.
Дислокация штаба: гг. Уфа (июнь-июль 1918), Сарапул (июль-авг. 1918, янв.-март 1919), с. Вятские Поляны, гт. Вятка (авг. -дек. 1918), Казань (апр. -июль 1919).
Войска армии вели оборонительные бои против чехословацкого корпуса и белогвардейцев в районах гг. Златоуст, Бирск, Уфа, отходили вниз по р. Каме в район гг. Сарапул, Елабуга (июнь-июль 1918), содействовали продвижением на Бирск и Бугульму наступлению 1 армии на Симбирск (авг. 1918); провели Ижевско-Воткинскую операцию (15 сент. -16 нояб. 1918) (освобождение гг. Ижевск, Воткинск, территории от Чистополя до Агрыза и Сарапула);участвовали в операциях, проведенных в ходе наступления Восточного фронта против армий Колчака (сент. 1918-февр. 1919): Казанской (5-10 сент. 1918) (содействие 5 армии в освобождении Казани), Пермской оборонительной (29 нояб. 1918-6 янв. 1919) (боинакунгурском и красноуфимском направлениях); в отходе под ударами противника (март-апр. 1919) (оставление гг. Мензелинск, Чистополь, Сарапул, Ижевск); в обеспечении контрнаступления главных сил фронта и проведении ими операций Бугурусланской (28 апр. -13 мая 1919) и Белебейской (15-19 мая 1919); участвовали в операциях: Сарапуло-Воткинской (25 мая-12 июня 1919) (форсирование р. Вятки, освобождение гг. Елабуга, Сарапул, Ижевск, ст. Агрыз, Боткинского завода); в Пермской наступательной (21 июня-1 июля 1919) (содействие 3 армии в освобождении г. Пермь наступлением на Кунгур, форсирование р. Камы, освобождение гг. Кунгур, Красноуфимск); Екатеринбургской наступательной (5-20 июля 1919) (освобождение Екатеринбурга).