Создан постановлением ЦИК и СНК СССР от 20 июня 1936 г., в его состав вошла Всесоюзная Государственная санитарная инспекция при СНК СССР, образованная 26 июля 1935 г.

В Наркомздраве СССР сосредоточивались общее руководство развитием здравоохранения в СССР и непосредственное управление курортами, санаториями и противоэпидемическими учреждениями общесоюзного значения, предприятиями медицинской промышленности, санитарный надзор за предприятиями пищевой промышленности.

Целый ряд организаций и учреждений передавался из ведения наркомздравов союзных республик, главным образом, из Наркомздрава РСФСР. В непосредственное подчинение Наркомздрава СССР перешли наиболее крупные курорты, санатории, лечебницы спецназначения, заводы медицинской промышленности, почти все медицинские научно-исследовательские институты и учреждения санитарного надзора.

Наркомату здравоохранения СССР были переданы все учреждения и организации системы Исполкома Союза обществ Красного Креста и Красного Полумесяца, а также судебно-медицинская экспертиза. Была учреждена должность главного судмедэксперта страны.

Большое внимание в предвоенные годы уделялось сельской медицине. По постановлению СНК СССР от 23 апреля 1938 г. «Об укреплении сельского врачебного участка» все амбулатории и больницы в сельской местности переводились с сельского на районный бюджет.

В годы Отечественной войны Наркомздрав СССР перестроил свою работу. Вместе с военными организациями он обеспечивал медицинское обслуживание армии, развернул сеть госпиталей.

В 1946 г. Наркомздрав СССР был переименован в Минздрав СССР. После войны Минздрав СССР осуществлял координацию и перспективное планирование в области медицины и непосредственно руководил крупными и важными учреждениями здравоохранения: рядом научно-исследовательских институтов, курортами и санатори�