Грамоты, памяти, указы Монастырского, Патриарших и др. приказов ростовских митрополитов, воевод, консистории 1711- 1917, отписки и рапорты монастырских властей 1711–1917.

Жалованные грамоты на вотчины (коп.) 1624, 1677.

Книги вкладные 1758, 1816–1911; записные и реестры исходящих 1766–1890 и входящих 1860–1914 документов; приходо-расходные штатных и др. денежных сумм 1766–1905, церковных сумм 1819–1916, кружечных сборов 1780–1904, сумм по «гостиному дому» 1779–1851, неокладных сумм 1819–1916, «трапезных» сумм 1851–1889.

Описи монастырских строений и имущества 1738, 1757, 1775–1796, 1803–1887, 1904–1916; ризницы 1770, 1781, 1797, 1803, 1822, 1823, 1845, 1853, 1881; книг архимандрита Авраама 1775–1795; «прибылых и прикладных» вещей 1819–1850, ценных бумаг 1850–1888, библиотеки 1860.

Ведомости о рекрутском наборе 1738–1758, личном составе монастыря, в т. ч. послужные списки (и табели) 1759–1916, монастырских крестьянах 1762; «генеральная ведомость о монашествующих» (с 1624) 1850.

Дела и документы 1730–1919: об аренде разными лицами монастырских владений – сенокосных пустошей Перевесы и Ишины 1790–1914, Исарской мельницы (совместное владение с Ростовским Авраамиевым Богоявленским монастырем) 1794- 1871, оз. Рюмниковского 1799–1913, принадлежавших монастырю зданий в Ростове XIX – н. XX в.; о завещаниях и пожертвованиях монастырю движимости и недвижимости разными лицами, в т. ч. Александром I, Николаем I, гр. А.А. Орловой-Чесменской 1823–1916; о реставрации монастырских построек 1863 – н. XX в.; об устройстве богадельни, больницы и училища (в т. ч. сметы и планы) 1871, 1886, 1913; об исключении из ризницы ветхих предметов 1873; о личном составе монастыря 1730- 1920.

Дела и документы отделений Библейского общества 1818- 1824 и Общества призрения 1846–1856 в монастыре.

Рукописные сборники, дневники и выписки из различных светских и духовных сочинений 1741–1870. Историческое описание Ростово-Ярославской иерархии 1841, «Книга о настоятелях» XIX в.