В 1852 был образован МАМЮ путем объединения трех самостоятельных исторических архивов, состоявших при московских департаментах Сената: Разрядно-Сенатского, Московского государственного архива старых дел и Архива прежних вотчинных дел.

Разрядно-Сенатский архив возник в 1763 при разделении Сената на 6 департаментов и ликвидации Московской сенатской конторы. Архив конторы (Сенатский архив) был объединен с хранившимся при ней Разрядным архивом. Это объединение происходило в течение длительного времени.

В 1711 после упразднения Разрядного приказа его архив был передан сначала в ведение Разрядного стола Сената, с 1715 – в ведение Канцелярии сенатского правления в Москве, в 1772 подчинен Канцелярии Московских герольдмейстерских дел. Тогда же складывается архив при учрежденной в 1722 Московской Сенатской конторе. В 1735 оба архива находились в ведении одного секретаря, в 1744 в Сенатский был назначен особый секретарь, а в 1749 этот архив снова передан в ведение секретаря Разрядного архива. В 1763 официально учрежден исторический Разрядный архив, в который как его часть вошел Сенатский. Таким образом, оба архива получили общее управление, но комплектование их осуществлялось обособленно.

Еще с 1707 в архив Разрядного приказа начали поступать дела Малороссийского приказа, прием которых проводился и позднее, в 1757–1760. В 1743 были приняты дела Канцелярии генерала М.Я. Волкова. В течение XVIII в. сюда переданы документы архива Сибирского приказа, дела по Молдавии и Валахии, столбцы Верхотурской приказной избы, архивы Канцелярии Московских герольдмейстерских дел, Раскольничьей и Московской Печатной контор, а также документы следственных комиссий – о пожаре в Москве 29 мая 1737, о Суровских рядах, о членах Иркутского магистрата и назначенном для расследования их злоупотреблений П.Н. Крылове, об Артиллерийской конторе и Генерал-кригс-комиссариате.

В Сенатском отделении Разрядно-Сенатского архива в течение XVIII в. постепенно концентрировались дела Сената и его Московской конторы, Верховного тайного совета, личных канцелярий монархов, Вышнего суда, а также дела ряда контор и коллегий, решенные в Сенате и уже не отсылавшиеся обратно. Особый секретный отдел составляли «дела с известным титулом», относящиеся к царствованию Ивана VI Антоновича 1740–1741.

Московский государственный архив старых дел образован в 1782 для хранения дел московских учреждений, упраздненны�