Образован 1 января 1949 г.

Оказывал большое влияние на хозяйственную, организационную, идейную и культурно-массовую деятельность Главного управления. На заседаниях парткома регулярно заслушивались отчеты руководителей всех управлений и отделов о выполнении производственных планов, морально-политическом климате, состоянии идеологической работы среди коммунистов и беспартийных, о комсомольской и профсоюзной работе. Руководил партийно-организационной и политико-воспитательной работой в первичных партийных организациях Главного управления. В состав парткома в 1954 г. входили 15 первичных партийных организаций, 407 коммунистов и 15 кандидатов в члены КПСС.

Ликвидирован постановлением Совета Министров СССР от 8 июня 1957 г. N 585 в связи с реорганизацией ГУСДС МЦМ СССР и созданием на его базе Совета народного хозяйства Магаданского экономического административного района.