Дальневосточная транспортная прокуратура была образована в соответствии с приказом Генерального прокурора СССР от 1 октября 1980 г. N 548-л.

  Основные функции прокуратуры: надзор за соблюдением законности, борьба с преступлениями и правонарушениями на железной дороге, в Дальневосточном и Магаданском управлениях гражданской авиации, Амурском речном, Дальневосточном, Приморском, Сахалинском и Камчатском морских пароходствах, на рыбопромысловом флоте и в рыбных портах Всесоюзного производственного объединения "Дальрыба".

  В соответствии с Федеральным законом от 17 января 1992 г. N 2202-1 "О прокуратуре РФ" транспортные прокуратуры перешли в подчинение Генерального прокурора РФ.

  На основании приказа Генерального прокурора Российской Федерации от 1 августа 1997 г. N 121-ш и в соответствии с постановлением Правительства РФ от 20 ноября 1996 г. N 1377 "О присоединении Байкало-Амурской железной дороги к Дальневосточной железной дороге" в состав Дальневосточной транспортной прокуратуры были введены Нерюнгринская, Тындинская и Ургальская транспортные прокуратуры.

  Дальневосточная транспортная прокуратура ликвидирована на основании приказа Генерального прокурора Российской Федерации от 22 января 2001 г. N 2, ее правопреемником назначена прокуратура Хабаровского края.