В соответствии с утвержденным 2 февр. 1919 г. новым положением об Особом совещании при Главнокомандующем ВСЮР Военный отдел был переименован в Военное управление и часть Генерального штаба была переименована в Отдел Генерального штаба Военного управления Особого совещания при Главнокомандующем ВСЮР. Контрразведывательная часть входила в состав Особого отделения Отдела Генерального штаба Военного управления.

В ряде городов и станиц Юга России создавались контрразведывательные пункты. В портовых городах в разное время открывались паспортные пропускные пункты. Пункты были открыты в Новороссийске, Севастополе (май – июнь 1919), Керчи (июнь 1919), Евпатории (авг. 1919), Одессе, Феодосии (сент. 1919), Ялте (дек. 1919), в Константинополе (сент. 1919). Начальники паспортных пропускных пунктов являлись одновременно уполномоченными Особого отделения Отдела Генерального штаба Военного управления. На паспортные пропускные пункты возлагались не только контроль за въездом на территорию ВСЮР и выездом за границу, но и осведомительная служба.

В Контрразведывательной части сосредоточивалась информация, содержавшаяся в докладах и рапортах начальников паспортных пропускных и розыскных пунктов, записках агентурной службы, изданиях Отдела пропаганды Особого совещания при Главнокомандующем ВСЮР. Наиболее содержательные рапорты с аналитическими материалами и инициативными предложениями представлялись начальником Новороссийского паспортного пропускного пункта полковником Р.Д. Мергиным.

Руководители Контрразведывательной частью Особого отделения: капит