Декретом ВЦИК СССР и СНК РСФСР от 22 сентября 1922 г. были созданы Высшая арбитражная комиссия при СТО РСФСР и арбитражные комиссии на местах при областных экономических совещаниях. Этим же декретом утверждалось «Положение о порядке разрешения имущественных споров между государственными управлениями и предприятиями».

Постановлением ЦИК СССР и СНК СССР от 7 апреля 1924 г. было утверждено Положение о Высшей арбитражной комиссии при СТО СССР.

Выполняла поручения СТО СССР, рассматривала имущественные споры между государственными учреждениями, организациями и предприятиями, а также протесты ведомств на решения СТО СССР.

Упразднена постановлением ЦИК СССР и СНК СССР от 4 марта 1931 г., но действовала до образования Государственного арбитража при СНК СССР в мае 1931 г.

Председателем Комиссии в 1924 г. был назначен П.А. Лебедев.

Фонд Комиссии поступил в ГА РФ (ЦГАОР СССР) из архива Управления делами Совета Министров СССР в 1948 г. по описям, составленным в ведомственном архиве.