Образована Постановлением Совета Народных комиссаров СССР от 30 июня 1944 года на базе Всесоюзного института экспериментальной медицины, являлась высшим медицинским научным учреждением СССР, объединяющим выдающихся ученых страны, работающих в области медицины и здравоохранения.

АМН СССР состояла при Министерстве здравоохранения СССР и подчинялась непосредственно Министру.

Основными задачами АМН СССР являлись: решение фундаментальных научных медицинских проблем, осуществление научных исследований по основным направлениям экспериментальной, профилактической и клинической медицины, научная апробация наиболее важных открытий и предложений в области медицины и подготовка рекомендаций для их использования в практике здравоохранения, изучение и обобщение достижений мировой науки и содействие наиболее полному их использованию в практике здравоохранения.

Высшим руководящим органом АМН СССР являлось Общее собрание действительных членов (академиков) и членов-корреспондентов АМН СССР, определявшее основные направления научных исследований в области медицины и решавшие основные организационные вопросы.

В период между сессиями Общего собрания высшим органом, руководящим всей работой академии, являлся Президиум АМН СССР, избираемый Общим собранием сроком на 4 года.

АМН СССР имеет в своем составе отделения с институтами, являющимися научными и научно-организационными центрами, объединяющими ученых академии по соответствующим разделам медицины.

Для руководства научной разработкой актуальных проблем в области медицины и для координации научных исследований с научно-исследовательскими институтами страны при Президиуме АМН СССР созданы научные советы и про