Была открыта усилиями членов Псковского археологического общества (ПАО) осенью 1913 г. как Псковская художественно-ремесленная школа. Названа в честь Николая Фёдоровича Фан-дер-Флита – известного мецената, директора Русского общества пароходства и торговли, деятеля Псковского уездного земства, члена ПАО, который завещал средства на устройство данной школы. Устав школы был утверждён Министерством торговли и промышленности 20 ноября 1909 г. Директором школы был назначен Николай Фёдорович Роот.

Целью школы было обучение художественным познаниям и техническим навыкам, необходимым для работы по керамике, стеклу, кузнечно-слесарному и столярно-резному делу. Учебная программа сочетала общеобразовательные предметы, художественные и специальные, а также практическую работу в мастерских.

14 декабря 1913 г. Министерством торговли и промышленности был утверждён новый устав школы, согласно которому она была преобразована в художественно-промышленную.

С 1 октября 1918 г. все учебные заведения всех ведомств были переданы в ведение Наркомата просвещения.

Была закрыта на основании решения коллегии отдела народного образования Псковского губисполкома от 28 августа 1924 г. «ввиду неимения средств на содержание школы и отсутствие производственного базиса».