20 апреля 1898 г. было получено высочайшее соизволение на отведение Псковскому губернскому земству в безвозмездное пользование под устройство колонии для душевнобольных участка из Подборовской казённой лесной дачи Псковского лесничества. Торжественная закладка колонии состоялась 27 августа 1900 г. В июле 1905 г. все душевнобольные были перевезены из психиатрического отделения губернской земской больницы в Черняковскую колонию, рассчитанную на 350 коек. Первым заведующим колонией был доктор Павел Фёдорович Горошков.

На территории колонии существовала начальная школа для детей служащих колонии и крестьян окрестных деревень, была устроена железнодорожная платформа около д. Черняковицы, дорога от колонии до этой платформы.

Согласно протоколу заседания исполнительного комитета Псковского губернского Совета рабочих, солдатских и крестьянских депутатов N 15 от 23 января 1918 г. колония перешла в ведение врачебно-санитарного отдела.