Армия образована директивой командования Восточного фронта No.44 от 19 июня 1918 г. из частей и отрядов, действовавших против чехословацких и белогвардейских войск на сызранско-симбирском направлении.
Для выполнения отдельных оперативных задач в составе армии создавались временные оперативные группы: Вольская (17 июля-30 авг. 1918), Алатырская (6 авг. -22 сент. 1918), Белебейская (19 нояб. -27 дек, 1918), Стерлитамакская (8 янв.-20 февр. 1919), Ахтюбинская (27 февр.-3 марта 1919), Уфимская (14 марта-8 апр. 1919), Левая ударная (8-23 апр. 1919), обороны Оренбурга (19 апр. -17 июня 1919), Бузулукская (2-18 июня 1919), Ударная И. М. Плясункова (16-30 июля 1919).
В соответствии с решением совместного совещания РВСР и РВС Восточного фронта от 10 апреля 1919 г. директивой РВС фронта No.01161 от 10 апреля 1919 г. армия передавалась в состав Южной группы войск фронта, с преобразованием последней в Туркестанский фронт вошла в его состав (директива Главкома No.1165/ш от 11 августа 1919 г.).
Для подавления восстания белоказаков в районе Илецкого Городка по приказу РВС армии 3 мая 1919 г. была создана Особая группа войск из нескольких полков. По приказу войскам армии No.19 от 17 июня 1919 г. группа вошла в состав 2 бр формируемой Оренбургской (впосл. 49) сд.
Для овладения гг. Орск, Актюбинск приказом войскам армии No.33 от 15 августа 1919 г. была создана Оренбургская группа войск (3 кд, 1 и 2 бр 49 сд, 1 бр 20 сд и др.). Приказом войскам армии No.36 от 2 сентября 1919 г. расформирована. В подчинении армии находился Оренбургский укрепрайон (сент. -дек. 1919).
После соединения (13 сентября 1919 г.) южнее Актюбинска 1 армии с частями Северо-Восточного фронта Туркестанской республики последние приказом войскам Туркестанского фронта No.88 от 16 сентября 1919 г. сводились в группу туркестанских войск А. И. Астраханцева и включались в состав 1 армии.
С целью ликвидации белоказачьих войск в районе между р. Урал и ж.д. Илецк-Уральск приказом командования Туркестанского фронта No.3584 от 7 октября 1919 г. в составе армии была образована Ил едкая группа войск (1 и 3 бр 49 сд, Башкирская кбр). Приказом командования фронта No.03761 от 26 октября 1919 г. она передавалась в оперативное подчинение 4 армии. На основании приказа войскам фронта No.72 от 17 ноября 1919 г. группа с 1 декабря 1919 г. передавалась в 4 армию во всех отношениях (приказ войскам 1 армии No.428 от 4 декабря 1919 г.).
По директиве РВС Туркестанского фронта 153/оп от 14 декабря 1919 г. в состав армии включались войска расформировываемой Закаспийской армейской группы (1 Туркестанская сд, Хивинская группа, Амударьинская речная флотилия и др.), образованной из упраздненного Закаспийского фронта Туркестанской республики (приказ войскам Туркестанского фронта No.11 от 22 ноября 1919 г.).
Вместе с Закаспийской армейской группой входившая в нее Хивинская (Петроалександровская) группа войск включалась в состав 1 армии. Ее предшественником послужил Хивинский фронт (отряд), созданный в марте 1919 г. из войск, охранявших низовье Амударьи. В июне 1919 г. фронт был преобразован в Амударьинскую экспедицию, а 21 августа 1919 г. (вместе с Петроалександровским гарнизоном и Чарджуйским отрядом) в Хивинскую (Петроалександровскую) группу войск Закаспийского фронта (впосл. Закаспийской армейской группы).
С образованием в феврале 1920 г. Хорезмской народной советской республики все войска, действовавшие на этой территории, в том числе Хивинская группа, с 3 апреля 1920 г. образовали Амударьинскую группу войск. В соответствии с директивой командования Туркестанского фронта No.2182/оп от 2 июня 1920 г. приказом войскам 1 армии No.171 от 13 июня 1920 г. части группы включались в состав 1 Туркестанской сд, а ее управление обращалось на пополнение штаба 2 сбр.
Директивой командования фронта No.00257/пш от 1 сентября 1920 г. в оперативное подчинение армии передавалась Самаркандско-Бухарская группа войск. По приказу войскам фронта No.4252 от 30 сентября 1920 г. штаб группы обращался на формирование Управления Ферганской армейской группы, а части приказом войскам армии No.468 от 29 октября 1920 г. включались в 3 Туркестанскую сбр.
Приказом войскам армии No.84/3269 от 9 ноября 1920 г. для объединения войск на территории Бухарской республики, ликвидации остатков войск эмира и укрепления Советской власти в Восточной Бухаре была образована Бухарская группа войск. Войска подчинялись штабу 3 Туркестанской сбр, переименованному в штаб группы. Приказом войскам фронта No.5495 от 19 декабря 1920 г. передана в подчинение фронта.
Приказом войскам армии No.0120 от 8 января 1920 г. объявлялось о подчинении армии Амударьинской речной флотилии.
Приказом РВСР No.275 от 2 февраля 1921 г. штаб армии с 1 января 1921 г. расформировывался, личный состав передавался во вновь сформированный штаб 1 Туркестанской сд.
Дислокация штаба: ст. Инза (июнь-авг. 1918), ст. Пайгарма (сент. -окт. 1918), гг. Сызрань (окт. 1918-янв. 1919), Оренбург (янв. -апр. 1919, авг. 1919-февр. 1920), ст. Сорочинская (май 1919), гг. Бузулук (июнь-авг. 1919), Полторацк (март 1920-янв. 1921).
Войска армии вели бои против чехословацкого корпуса и белогвардейцев в Поволжье (июль-авг. 1918), участвовали в операциях, проведенных в ходе наступления Восточного фронта (сент. 1918-февр. 1919): Симбирской (9-28 сент. 1918) (форсирование Волги, освобождение г. Симбирска), Сызрань-Самарской (14 сент. -8 окт. 1918) (освобождение гг. Сызрань, Ставрополь, района Самарской Луки), в преследовании противника (освобождение гг. Бугуруслан, Бузулук, Белебей, Стерлитамак, Оренбург, Уральск, Илецкий Городок, Орск, соединение с войсками Туркестанской республики в Актюбинске); участвовали в трех последовательных операциях, проведенных в ходе контрнаступления Восточного фронта против армий Колчака (28 апр. -20 июня 1919):Бугурусланской (28 апр. -13 мая 1919) (вспомогательный удар на г. Белебей, оборона Оренбурга), Белебейской (15-19 мая 1919) (освобождение г. Белебей), Уфимской (25 мая-19 июня 1919) (освобождение г. Стерлитамак); в составе Туркестанского фронта участвовали в Актюбинской операции (14 авг. -14 сент. 1919) по разгрому Южной армии Колчака и белоказачьей Уральской армии (освобождение гг. Орск, Актюбинск, соединение с войсками Туркестанской республики у ст. Мугоджарская), в наступлении в Закаспии (освобождение ст. Айдын, Джебел, г. Красноводска) (дек. 1919-янв. 1920), в освобождении нефтяных промыслов в районе ст. Нефтяная, острова Челекен, ст. Доссор, Эмба (февр. 1920), вели борьбу с басмаческими формированиями в Хиве (февр. 1920), участвовали в Бухарской операции (29 авг.-2 сент. 1920) (освобождение крепости Старая Бухара), провели Гиссарскую экспедицию по ликвидации остатков бухарских войск в Гиссарском бекстве (дек. 1920-янв. 1921).