В октябре 1928 г. образована городская часть здравоохранения Ойрот-Туринского горисполкома, 13 ноября 1936 г. переименована в отдел здравоохранения Ойрот-Туринского горисполкома, с января 1948 г.-отдел здравоохранения Горно-Алтайского горисполкома.
Руководит деятельностью органов здравоохранения на территории города.